Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX6P78412 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX6P78412 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IRX6P78412 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms