Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPAP49450 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPAP49450 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPAP49450 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPAP49450 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPAP49450 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPAP49450 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPAP49450 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPAP49450 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPAP49450 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPAP49450 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPAP49450 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPAP49450 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms