Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CDKN1BP46527 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms