Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRATP43155 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRATP43155 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRATP43155 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms