Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms