Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASQ1P31415 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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