Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2E1P29083 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms