Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA1P25786 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA1P25786 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA1P25786 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA1P25786 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMA1P25786 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PSMA1P25786 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PSMA1P25786 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PSMA1P25786 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PSMA1P25786 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PSMA1P25786 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PSMA1P25786 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA1P25786 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms