Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSR1P21757 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSR1P21757 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSR1P21757 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSR1P21757 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSR1P21757 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSR1P21757 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms