Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGCP20142 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGCP20142 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGCP20142 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGCP20142 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGCP20142 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGCP20142 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGCP20142 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGCP20142 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGCP20142 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms