Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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