Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms