Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHGAP10645 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHGAP10645 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms