Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms