Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms