Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms