Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPP2O95045 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UPP2O95045 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms