Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F6O75461 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F6O75461 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms