Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms