Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM6BO15054 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms