Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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LINC00587B1AMM8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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LINC00587B1AMM8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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