Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KNCNA6PVL3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms