Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C9orf92A6NGG3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms