Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT87PA6NCN2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms