Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms