Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms