Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUBP2Q9Y5Y2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms