Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM2AQ9Y2K7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms