Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms