Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IQSEC3Q9UPP2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IQSEC3Q9UPP2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms