Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms