Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYH13Q9UKX3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYH13Q9UKX3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms