Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms