Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms