Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms