Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDIT4Q9NX09 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms