Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NLRC4Q9NPP4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms