Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1B3Q9NPD5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms