Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB9BQ9NP90 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms