Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GSX2Q9BZM3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms