Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms