Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms