Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIOK2Q9BVS4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIOK2Q9BVS4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms