Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAGR1Q9BTK6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms