Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms