Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GORASP1Q9BQQ3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GORASP1Q9BQQ3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms