Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms