Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VRK1Q99986 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms