Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3GL2Q99962 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3GL2Q99962 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms