Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms